缓慢或无法访问的zenodo.org

通过 Alex Ioannidis, 2020年6月9日


在过去的一周中,我们的用户可能已经体验到Zenodo在某些时候运行缓慢或无法访问。这是由过去一周中发生的几起独立事件引起的。

5月30日,数据库连接过时(已解决)

5月30日,对zenodo.org的大部分请求都将导致错误。根本原因是由于客户端软件版本错误,数据库服务器与托管数据库文件的网络文件存储之间的连接陈旧。该事件发生在正常工作时间以外的欧洲夜间,并且需要CERN数据库基础结构专家的干预才能完全解决问题,不幸的是,这总共花费了10个小时来完全调查和解决问题。

异常流量模式(进行中)

在过去一周中,Zenodo受到自动客户端异常流量模式的打击,为此,我们现有的多种措施(例如限速)无法使访问zenodo.org的客户端之间的流量保持适当的平衡。

Zenodo的所有工作人员都已指派解决此问题,而且在过去一周中,我们已采取了几项措施,不幸的是,这些措施还不足以控制交通流量。我们将继续采取进一步的措施,但是,其中一些操作可与全速驾驶卡车上的轮胎更换相提并论,这需要时间,并且需要格外小心。

我们希望尽快控制流量,并为由此带来的不便深表歉意。



对抗冠状病毒疾病(COVID-19)

通过 Alex Ioannidis, 2020年4月2日


为了应对冠状病毒疾病(COVID-19)的迅速爆发,科学界需要做出非同寻常的合作努力,因此,需要跨学科,跨领域以前所未有的速度迅速采取行动,共享成果。开放科学是军械库中的理想武器,它可以通过无限制且及时地共享与大流行有关的最新研究来帮助对抗COVID-19。

我们(Zenodo / CERN和OpenAIRE)正在响应欧洲委员会的呼吁,要求欧洲开放科学云(EOSC)的重要举措之间采取同步行动和协作,以促进全球科学家为遏制这一流行病做出的不懈努力。

今天,我们以我们最擅长的方式为行动呼吁做出贡献—保留并共享所有与COVID-19相关的数据集,软件,预印本或任何其他可帮助科学界为该普遍问题找到突破性解决方案的研究对象。

我们已立即采取了一些行动:

  1. 冠状病毒疾病研究社区: 我们创建了一个新的 COVID-19研究社区 欧盟委员会认可的Zenodo上。社区内容会自动输入到 OpenAIRE开放研究网关 OpenAIRE目前正在开发该工具,它将为冠状病毒病(COVID-19)和SARS-CoV-2的所有研究结果和其他有用资源提供一个单一的切入点。
  2. 策展:已经建立了由OpenAIRE提名的专家团队(请参阅下面的列表)来管理COVID-19社区。此外,Zenodo正在添加一个数据管理器(@StephvandeSandt)搜寻社区之外的其他COVID-19上传文件,并与全球其他团队协调在Zenodo上的COVID-19策划工作。
  3. 支持: 我们不希望任何人在Zenodo上共享相关信息时遇到任何问题。请 联系我们 如有任何疑问(与COVID-19相关的支持请求优先)。我们可以进一步提供:

    • 如果需要,可以增加自由配额(超出当前的50GB限制)
    • 通过与Zenodo支持者聊天的一对一专用支持。
    • 帮助将大型数据集自动上传到Zenodo。
  4. 主页: 我们已经修改了首页,以确保COVID-19研究对象和社区获得必要的可见度。 主页

我们指望您找到爆发的解决方案。我们将竭尽全力为您提供支持,从分享您的出色研究到增强协作能力!

我们可以一起努力!

我们错过了什么吗?您想帮助我们吗?

我们欢迎任何希望通过公开更多相关信息,整理数据集甚至改善Zenodo功能,以任何方式帮助我们改善Zenodo COVID-19内容的人!请, 请与我们联系 并分享您的反馈。

冠状病毒疾病研究社区的策展团队

可以通过以下电子邮件地址与策展团队联系,以进一步说明或了解信息: covid19@openaire.eu.

馆长名单:

  • UGOE的Ilaria Fava,德国
  • 艾玛·拉泽里(Emma Lazzeri),CNR,意大利
  • 意大利CNR的Alessia Bardi
  • 乌克兰EIFL的Iryna Kuchma
  • 意大利CNR的Paolo Manghi
  • Stephanie van de Sandt,欧洲核子研究组织,瑞士。


树妖&Zenodo:我们的未来之路

通过 Alex Ioannidis, 2020年3月10日


在2019年7月,我们很荣幸地宣布 资金合伙 在Dryad和Zenodo之间。今天,我们很高兴能一起提供有关我们未来的最新信息。

树妖和Zenodo在过去十年中一直在开源数据,软件和其他研究成果发布方面处于领先地位。尽管我们的关注点和采用机制可能有所不同,但我们始终具有相似的价值观和目标:以开放和可访问的方式发布和存档非传统研究成果,以促进最佳实践。

在寻求扩大我们共享数据和软件的能力时,我们显然可以从彼此的专业知识中受益。 树妖长期以来一直专注于研究数据,整理每个已发布的数据集,并与出版商和社团紧密合作以支持期刊数据政策。位于欧洲核子研究组织(CERN)的Zenodo建立在强大的基础架构能力之上,并专注于软件发布和引用。显然,通过相互合作,利用彼此的专业知识,我们可以更好地实现我们的目标。值得注意的是,我们认为研究人员应该有机会以一种无缝的方式在可信任的开放源存储库中发布策划的数据,软件和其他研究成果。

2月初,我们将两个团队召集在一起,以了解存储库系统,路线图并规划未来的工作。如上所述,我们已将这项工作分为几个部分,并将从我们的第一个项目开始。 我们的Github,如“ DJ D-Zed:混合存储库”。换句话说,我们将集成我们的两个系统,以降低希望遵循最佳实践来发布软件,数据和支持信息的研究人员的障碍。关注的第一个方向是从Dryad到Zenodo。

组

那么,这一切看起来像什么?

该项目需要重新构想Dryad上传界面,以扩大上传范围,以适应研究人员上传更多数据。在此界面中,通过一系列声明和机器读取,我们将分类数据,软件和支持(其他)文件。数据应在Dryad进行整理和发布。软件需要一系列不同的许可证选项,元数据和其他属性,并且支持文件可从预览器中受益,因此,这些文件更适合在Zenodo上发布。

策展后,一旦准备好发布这些项目,至关重要的是我们必须将其工作与他们的DOI和引文链接起来。由于Dryad和Zenodo都为发布的作品制作了DOI,因此我们有责任公开软件,数据和其他引文之间的关系,以便用户可以找到所有相关作品。对软件和数据进行单独引用的好处将允许在期刊,预印本等上使用更多指定的引用实践。

板

我们必须承认用户测试的重要性,这一点至关重要。我们已经确定了最低限度可行的产品,但是其外观和感觉取决于与我们的用户体验团队和研究人员用户测试的紧密合作。只有当研究人员发现对两个存储库使用一个入口点的好处,并且受过有关数据和软件最佳实践的教育时,这种集成才能成功。我们将计划在特定的里程碑上提供反馈的机会,并一路欣赏通过电子邮件或github评论的评论。

接下来发生什么

我们的伙伴关系依靠跨组织的共同发展。我们的团队一直在花时间来了解Dryad和Zenodo的功能,以确保我们为每个用户社区都在成功发展。我们最初的用户测试即将开始,我们已经开始探索后端开发以将我们的系统紧密联系在一起。作为狂热的开源支持者,我们所有的工作将 公开跟踪 在Github上。随着新功能的发布,我们的代码和文档也将可用。

用户与研究人员一起测试我们的工作流程将有助于指导我们的发展,但我们还需要了解这项工作如何为Dryad和Zenodo的更大社区提供支持:机构,图书馆,出版商,社会,资助机构以及其他与研究数据和软件发布。我们会定期提供反馈,希望您能多加考虑。

查看我们的博客以获取更新,以及查看我们的Twitter,以了解即将举行的会议。如果您有任何反馈意见,请与我们的产品经理一如既往地联系 树妖Zenodo.